Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CMPK1P30085 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CMPK1P30085 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms