Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCKSP29966 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCKSP29966 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms