Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IL3RAP26951 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms