Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTX3P26022 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTX3P26022 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTX3P26022 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTX3P26022 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms