Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNA5P22460 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNA5P22460 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms