Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EPHA1P21709 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms