Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCP20941 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCP20941 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCP20941 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCP20941 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCP20941 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCP20941 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCP20941 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCP20941 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCP20941 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCP20941 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms