Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B1P20020 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms