Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM21P19474 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM21P19474 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms