Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF6P18850 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF6P18850 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF6P18850 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF6P18850 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF6P18850 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF6P18850 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms