Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL17P18621 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL17P18621 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL17P18621 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL17P18621 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL17P18621 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL17P18621 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL17P18621 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL17P18621 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms