Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRAP18433 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRAP18433 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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