Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN1P18031 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms