Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCP1P17987 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCP1P17987 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCP1P17987 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCP1P17987 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCP1P17987 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCP1P17987 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms