Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB1P16220 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CREB1P16220 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB1P16220 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB1P16220 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB1P16220 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB1P16220 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB1P16220 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms