Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSP16219 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSP16219 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSP16219 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSP16219 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACADSP16219 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSP16219 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms