Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG2P13521 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG2P13521 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCG2P13521 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG2P13521 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCG2P13521 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCG2P13521 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms