Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN1P12814 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN1P12814 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms