Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP2C9P11712 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP2C9P11712 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms