Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TOP2AP11388 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TOP2AP11388 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TOP2AP11388 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms