Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRM1P11229 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRM1P11229 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms