Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PF4V1P10720 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PF4V1P10720 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms