Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GLI3P10071 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI3P10071 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI3P10071 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI3P10071 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI3P10071 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GLI3P10071 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI3P10071 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI3P10071 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GLI3P10071 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GLI3P10071 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GLI3P10071 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GLI3P10071 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GLI3P10071 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GLI3P10071 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI3P10071 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI3P10071 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GLI3P10071 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GLI3P10071 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms