Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM10L2BP0DMW5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM10L2BP0DMW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms