Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTAP09496 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTAP09496 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTAP09496 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTAP09496 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTAP09496 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTAP09496 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTAP09496 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTAP09496 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTAP09496 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTAP09496 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTAP09496 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTAP09496 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTAP09496 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTAP09496 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTAP09496 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms