Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRCP08575 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRCP08575 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms