Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPM2P07951 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPM2P07951 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPM2P07951 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms