Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSF1RP07333 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSF1RP07333 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms