Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPIND1P05546 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPIND1P05546 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms