Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB3P05106 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB3P05106 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms