Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGAP02671 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGAP02671 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGAP02671 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FGAP02671 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGAP02671 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGAP02671 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGAP02671 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGAP02671 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGAP02671 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms