Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD4P01730 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD4P01730 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD4P01730 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD4P01730 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD4P01730 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD4P01730 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD4P01730 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD4P01730 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD4P01730 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD4P01730 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms