Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTAP01374 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTAP01374 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTAP01374 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTAP01374 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTAP01374 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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