Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBA3O96018 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBA3O96018 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBA3O96018 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
APBA3O96018 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APBA3O96018 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
APBA3O96018 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
APBA3O96018 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBA3O96018 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBA3O96018 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBA3O96018 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms