Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOP3BO95985 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOP3BO95985 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms