Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRUB2O95900 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRUB2O95900 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms