Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR1AO95602 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR1AO95602 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms