Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN1O94985 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN1O94985 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms