Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UFL1O94874 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UFL1O94874 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UFL1O94874 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UFL1O94874 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UFL1O94874 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UFL1O94874 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UFL1O94874 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UFL1O94874 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UFL1O94874 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UFL1O94874 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms