Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEC24DO94855 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24DO94855 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms