Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN15O75808 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN15O75808 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms