Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAMP4O75379 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAMP4O75379 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAMP4O75379 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms