Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSCO60682 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSCO60682 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSCO60682 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSCO60682 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSCO60682 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MSCO60682 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSCO60682 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSCO60682 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSCO60682 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms