Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPLO60437 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPLO60437 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPLO60437 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPLO60437 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPLO60437 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPLO60437 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPLO60437 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPLO60437 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPLO60437 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPLO60437 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPLO60437 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms