Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KIAA0556O60303 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KIAA0556O60303 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KIAA0556O60303 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KIAA0556O60303 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KIAA0556O60303 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KIAA0556O60303 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KIAA0556O60303 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
KIAA0556O60303 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
KIAA0556O60303 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KIAA0556O60303 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KIAA0556O60303 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms