Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAK2O60296 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAK2O60296 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms