Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXTL3O43909 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXTL3O43909 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXTL3O43909 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms