Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA2O43464 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA2O43464 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA2O43464 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA2O43464 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA2O43464 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA2O43464 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA2O43464 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms