Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSI1O43347 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI1O43347 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSI1O43347 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSI1O43347 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSI1O43347 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSI1O43347 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MSI1O43347 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MSI1O43347 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MSI1O43347 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSI1O43347 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSI1O43347 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSI1O43347 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSI1O43347 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms