Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LRRTM2O43300 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRRTM2O43300 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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